資金収支計算書・事業活動収支計算書の補助活動収入・支出の金額と　元帳の金額が異なる。

資金収支計算書・事業活動収支計算書の補助活動収入・支出の金額と　元帳の金額が異なる。: マスタ登録→勘定科目→純額設定で、補助活動収入・支出を
純額設定していると思われます。
この場合、決算書上では純額（相殺）表示され、元帳は
総額表示（入力した科目それぞれで表示）されます。